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| Registros recuperados: 57 | |
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| Ky, Chin-long; Barre, Philippe; Noirot, Michel. |
| The objective of the paper was to identify the number of major loci explaining caffeine content in coffee seeds. Investigations were based on previously published results: (1) Caffeine binds to chlorogenic acids in a 1:1 molecular ratio; (2) Between species, the caffeine content is correlated to the chlorogenic acid content; (3) Only a part of chlorogenic acids is bound to caffeine. Especially, the content ratio between caffeine and chlorogenic acids varied between species. For identifying the number of major loci, a quantitative trait locus (QTL) approach was carried out using an interspecific cross between two highly differentiated species-Coffea liberica dewevrei and Coffea pseudozanguebariae, the latter being a caffeine-free species. As main finding,... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Coffea; Chlorogenic acids; Caffeine; QTL; Interspecific cross. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26298/24429.pdf |
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| Lallias, Delphine. |
| Genetic linkage maps consist of ordering molecular markers across the genome and require a high number of markers for a good coverage of the genome. Such maps represent a framework which enables the identification and localisation of Quantitative Trait Loci (QTLs) for traits of interest, such as growth or disease resistance, with the final aim of achieving genetic improvement through marker-assisted selection (MAS). Data on bivalves are scarce. No genetic map has yet been constructed in any mussel or flat oyster species. We report construction of a preliminary genetic linkage map in the blue mussel, Mytilus edulis (n=14). Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers were used in a mapping family containing 86 full-sibs issued from a controlled... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Microsatellite; AFLP; Mussel; Flat oyster; QTL; Genetic mapping; Microsatellite; AFLP; Moule; Huître plate; QTL; Cartographie génétique. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-2603.pdf |
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| Blay, Carole; Haffray, Pierrick; Bugeon, Jérôme; D’ambrosio, Jonathan; Dechamp, Nicolas; Collewet, Guylaine; Enez, Florian; Petit, Vincent; Cousin, Xavier; Corraze, Geneviève; Phocas, Florence; Dupont-nivet, Mathilde. |
| One of the top priorities of the aquaculture industry is the genetic improvement of economically important traits in fish, such as those related to processing and quality. However, the accuracy of genetic evaluations has been hindered by a lack of data on such traits from a sufficiently large population of animals. The objectives of this study were thus threefold: (i) to estimate genetic parameters of growth-, yield-, and quality-related traits in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) using three different phenotyping technologies [invasive and non-invasive: microwave-based, digital image analysis, and magnetic resonance imaging (MRI)], (ii) to detect quantitative trait loci (QTLs) associated with these traits, and (iii) to identify candidate genes present... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Aquaculture; Fat content; Flesh colour; Magnetic resonance imaging; Fatmeter; Computer vision; Genetic correlations; QTL. |
| Ano: 2021 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00682/79410/81958.pdf |
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| Salerno,Juan Carlos; Kandus,Mariana; Boggio Ronceros,R.; Sorarrain,O.; González,Cecilia; Almorza,David. |
| The objective of this work is to study the genetic process related to the hybrid vigour (heterosis) and the identification of quantitative trait loci (QTL) in maize. A biometric model was built using the mathematical formalism relating to the discrete absorbent Markov chain in canonical form, in order to analyse the evolution of chromosome segments, with recessive lethal genes linked with grain yield factors through generations. The grain yield obtained from an inbred maize line regulated by a balanced lethal system, and other lines without this system as control, were evaluated during five inbreeding generations. The use of the Markov chain theory for the study of evolution during these generations was a different approach of the classical mathematical... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Maize; Lethal alleles; Heterosis; Markov Chains; QTL. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332007000100003 |
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| Martínez,Rodrigo; Bejarano,Diego; Gómez,Yolanda; Dasoneville,Romain; Jiménez,Ariel; Even,Gael; Sölkner,Johann; Mészáros,Gabor. |
| Abstract Genotypic and phenotypic data of 1,562 animals were analyzed to find genomic regions that potentially influence the birth weight (BW), weaning weight at seven months of age (WW) and yearling weight (YW) of Colombian Brahman cattle, with genotyping conducted using Illumina Bead chip array with 74,669 SNPs. A Single Step Genomic BLUP (ssGBLP), approach was used to estimate the proportion of variance explained by each marker. Multiple regions scattered across the genome were found to influence weights at different ages, also dependent on the trait component (direct or maternal). The most interesting regions were connected to previously identified QTLs and genes, such as ADAMTSL3, CAPN2, CAPN2, FABP6, ZEB2 influencing growth and weight traits. The... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Bos indicus; SNP; QTL; GWAS; Body weight. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000300453 |
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| Kottearachchi, NS; Uchino, N.; Kato, Kiyoaki; Miura, Hideho; 加藤, 清明; 三浦, 秀穂. |
| White-grained wheat cultivars have long been recognized to be less resistant to preharvest sprouting (PHS) than the red-grained ones. Previously two QTLs for grain dormancy, QPhs.ocs-3A.1 (QPhs-3AS) and QPhs.ocs-4A.1 (QPhs-4AL) were identified in a highly dormant Japanese red wheat, Zenkoujikomugi (Zen). Aiming at improvement of PHS tolerance in white-grained wheat, the introgression effect of these two QTLs in a white-grained population consisting of 40 recombinant inbred lines (RILs) developed from a cross between Zen and white-grained Spica was examined here. Random 20 RILs with red grains were also developed from the same cross and used as a control population. The RILs were grown in the field and in the glasshouse to evaluate the grain dormancy by... |
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Palavras-chave: Grain dormancy; Molecular marker; QTL; Triticum aestivum; White-grained wheat. |
| Ano: 2006 |
URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/714 |
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| Carneiro,Monalisa Sampaio; Vieira,Maria Lucia Carneiro. |
| Ao lado dos projetos de seqüenciamento e das análises do cariótipo pelas técnicas de hibridização in situ, o desenvolvimento de mapas genéticos fundamentados em marcadores de DNA tem propiciado consideráveis avanços à genômica de plantas. Esta revisão aborda as premissas básicas utilizadas para o mapeamento genético e suas principais aplicações, especialmente para o melhoramento vegetal. Fundamentos teóricos sobre segregação, recombinação e ligação são considerados e relacionados à construção de mapas genéticos com marcas moleculares. Apresentam-se informações sobre tipos de marcadores, populações de mapeamento, cálculo da freqüência de recombinação, distorções da segregação, estabelecimento dos grupos de ligação e da ordenação dos marcadores. Discute-se,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/other |
Palavras-chave: Mapas de ligação; Marcadores moleculares; QTL; Mapeamento comparativo. |
| Ano: 2002 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052002000200002 |
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| Pires,A.V.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F.; Guimarães,C.T.; Peixoto,J.O.. |
| Uma população de suínos, composta de 550 animais F2, foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. O objetivo do trabalho foi mapear locos de características quantitativas (QTL) associados a cortes de carcaça. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites, distribuídos no cromossomo 6 de suínos. As características avaliadas foram: peso total do pernil, peso do pernil sem pele e sem capa de gordura, peso total da copa, peso da copa sem pele e sem capa de gordura, peso total da paleta, peso da paleta sem pele e sem capa de gordura, peso total do carré, peso do lombo, peso total do bacon, peso das costelas, peso total da... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Suíno; QTL; Cruzamento divergente; Composição de carcaça; Microssatélites. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000300030 |
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| Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni. |
| Com o objetivo de mapear locos de características quantitativas (QTLs) associados às características de carcaça e de órgão internos, uma população composta de 550 animais F2 foi produzida a partir do intercruzamento da geração F1, obtida pelo cruzamento divergente de dois machos da raça nativa brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais. Os animais foram genotipados para 13 marcadores microssatélites distribuídos no cromossomo 6. As características avaliadas foram: comprimento de carcaça pelos métodos brasileiro e americano, peso e rendimento de carcaça, espessura de toucinho na região da copa, espessura de toucinho imediatamente após a última costela, espessura de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar, menor espessura de toucinho na região... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Cruzamento divergente; Genética molecular; Melhoramento animal. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600012 |
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| Silva,M.V.G.B; Martinez,M.L.; Torres,R.A.; Lopes,P.S.; Euclydes,R.F.; Machado,M.A.; Arbex,W.. |
| Foi realizado um estudo por meio de simulação para avaliar a eficiência e o poder dos modelos aleatórios na estimação da localização e dos componentes de variância relativos a dois QTLs presentes no mesmo cromossomo, posicionados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes ou não. Admitiram-se diferentes tamanhos e números de famílias de irmãos completos e variâncias dos QTLs, em característica com herdabilidade igual a 0,25. A estimação dos parâmetros foi obtida por meio do método da máxima verossimilhança, baseado no quadrado da diferença de pares de irmãos, sob mapeamento por intervalo. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir da proporção IBD de dois marcadores flanqueadores. Os fatores que mais... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL. |
| Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352004000200014 |
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| Smith, Seth R.; Amish, Stephen J.; Bernatchez, Louis; Le Luyer, Jeremy; Wilson, Chris; Boeberitz, Olivia; Luikart, Gordon; Scribner, Kim T.. |
| Understanding the genomic basis of adaptative intraspecific phenotypic variation is a central goal in conservation genetics and evolutionary biology. Lake trout (Salvelinus namaycush) are an excellent species for addressing the genetic basis for adaptive variation because they express a striking degree of ecophenotypic variation across their range; however, necessary genomic resources are lacking. Here we utilize recently-developed analytical methods and sequencing technologies to (1) construct a high-density linkage and centromere map for lake trout, (2) identify loci underlying variation in traits that differentiate lake trout ecophenotypes and populations, (3) determine the location of the lake trout sex determination locus, and (4) identify chromosomal... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Linkage map; Salvelinus; QTL; RAD; Genomics; Lake trout. |
| Ano: 2020 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00634/74659/74565.pdf |
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| Nogueira,Danilo Gustavo; Maluf,Wilson Roberto; Nogueira,Douglas Willian; Maciel,Gabriel Mascarenhas; Paiva,Luciano Vilela; Figueira,Antônia dos Reis. |
| O objetivo deste trabalho foi associar um marcador microssatélite ao alelo Ty-1 de resistência a Begomovirus em tomateiro, e avaliar a eficiência desta associação na seleção de linhagens resistentes ao vírus. Os marcadores SSR-47 e SSR-48 foram testados em linhagens isogênicas contrastantes quanto à presença do alelo Ty-1 (LA-3473, LA-3474, LA-3475). O marcador SSR-47, por ter detectado polimorfismo nas linhagens, foi o único utilizado nas etapas subsequentes da pesquisa. Detectada a associação entre o SSR-47 e o alelo Ty-1, testou-se sua eficiência na seleção de genótipos avançados de tomateiro. Para confirmar a eficiência da seleção, foi realizada a avaliação fenotípica das plantas com padrões contrastantes de bandas para SSR-47, quanto à resistência a... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Geminiviridae; Lycopersicon esculentum; Solanum lycopersicum; QTL; Seleção assistida por marcadores. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000400011 |
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| Santos,Rogério Mercês Ferreira; Lopes,Uilson Vanderlei; Bahia,Rita de Cássia; Machado,Regina Celle Rebouças; Ahnert,Dário; Corrêa,Ronan Xavier. |
| Os objetivos deste trabalho foram caracterizar a resistência à vassoura-de-bruxa de plantas de cacau originadas do cruzamento entre TSH 1188 e CCN 51 (população segregante), por meio de dois métodos de inoculação em condições de campo, e identificar marcadores microssatélites específicos para grupos de plantas resistentes e suscetíveis. As plantas-controle avaliadas pelos métodos de inoculação natural e inoculação artificial em campo produziram os mesmos padrões de sintomas. As plantas da população segregante também coincidiram os padrões de sintomas em 90%, por esses dois métodos. O método de inoculação artificial em campo permite detectar falso-resistentes. Dos 18 pares de primers microssatélites amplificados, 15 foram polimórficos entre os genitores, e... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Theobroma cacao; Moniliophthora perniciosa; Inoculação; Marcador molecular; QTL; Melhoramento genético. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000800010 |
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| Silva,Marcos Vinicius G. Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Pereira,Carmen Silva; Machado,Marco Antônio; Arbex,Wagner. |
| O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h² = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL. |
| Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000100009 |
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| Cardoso,Juliana Morini Kupper; Oblessuc,Paula Rodrigues; Campos,Tatiana de; Sforça,Danilo Augusto; Carbonell,Sérgio Augusto Moraes; Chioratto,Alisson Fernando; Formighieri,Eduardo Fernandes; Souza,Anete Pereira de; Benchimol,Luciana Lasry. |
| The objective of this work was to develop new microsatellite markers in common bean. Ninety nine new microsatelitte loci were developed from a microsatellite enriched library for (CT)8 and (GT)8 motifs, from CAL-143 line. The majority of microsatellite sequences (51%) was related to cellular metabolism. The remaining sequences were associated to transcription functions. Only 17.2% of the sequences presented some level of similarity with other plant species genes. |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Molecular markers; Plant breeding; QTL; SSR. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000700019 |
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